RADAR4Chem am Inkubatorprojekt Jupyter4NFDI beteiligt

RADAR4Chem nahm gemeinsam mit Partnern aus dem NFDI4Chem-Konsortium und kooperierenden Institutionen am Inkubatorprozess 2026 des NFDI-Basisdienstes Jupyter4NFDI teil. Im Rahmen des Projekts wurde untersucht, wie Jupyter-Notebooks die Nachnutzung von Forschungsdaten erleichtern und den Zugang zu NFDI4Chem-Diensten und -Repositorien vereinfachen können.

Jupyter4NFDI stellt eine JupyterHub-Umgebung bereit, die es Forschenden ermöglicht, interaktive Notebooks für die Datenabfrage, -analyse und -verarbeitung zu entwickeln und auszuführen. Im Rahmen des Inkubatorprojekts wurden Demonstrations-Notebooks für mehrere NFDI4Chem-Dienste und -Repositorien erstellt, die veranschaulichen, wie standardisierte Schnittstellen in reproduzierbare Forschungsworkflows integriert werden können.

RADAR4Chem hat dafür ein Notebook entwickelt, das Abruf und Verarbeitung von Metadaten aus dem Repository veranschaulicht. Dabei kommen sowohl die RADAR REST API als auch der öffentliche SPARQL-Endpunkt des RADAR-Wissensgraphen zum Einsatz. Während die REST API Zugriff auf Repository-Ressourcen und Metadaten bietet, ermöglicht der SPARQL-Endpunkt flexible Abfragen zu Datensätzen, die mithilfe des standardisierten schema.org-Vokabulars dargestellt werden. Es wurden zudem Hilfsklassen entwickelt, um den Zugriff auf das RADAR-Repository (Daten und Metadaten) zu vereinfachen, ohne dass detaillierte Kenntnisse über die Endpunkte erforderlich sind.

Insgesamt hat das Inkubatorprojekt gezeigt, dass die Integration von Daten aus NFDI4Chem-Repositorien und -Diensten in Jupyter-Notebooks mithilfe bestehender APIs und standardisierter Schnittstellen unkompliziert möglich ist. Die daraus resultierenden Notebooks dienen als praktische Vorlagen für fortgeschrittenere Arbeitsabläufe, einschließlich der Kombination von Informationen aus mehreren Diensten, und werden zudem als Schulungsmaterial in zukünftigen Workshops verwendet werden.

Aufbauend auf den erfolgreichen Ergebnissen des ersten Inkubatorprojekts ist die Teilnahme an einem zweiten Jupyter4NFDI-Inkubatorprozess geplant, um die entwickelten Konzepte und Demonstratoren weiter auszubauen.